Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCD1Q6ZMY3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms