Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms