Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC25A47Q6Q0C1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms