Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF544Q6NX49 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms