Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD2Q6NTF9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms