Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3HQ6NTF7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms