Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3L3Q68CJ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms