Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OTUD1Q5VV17 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUD1Q5VV17 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms