Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms