Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q5VSD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms