Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFFO2Q5TF58 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFFO2Q5TF58 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms