Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms