Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CCNJQ5T5M9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCNJQ5T5M9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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