Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHSL1Q5SYE7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms