Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms