Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXN3Q5MJ09 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms