Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C5orf47Q569G3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms