Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms