Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBPF8Q3BBV2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms