Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms