Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDO1Q16878 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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