Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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