Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPROQ16827 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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