Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCK2Q16822 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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