Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFE2Q16621 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms