Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CTF1Q16619 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CTF1Q16619 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CTF1Q16619 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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