Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TNXAQ16473 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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