Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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E2F4Q16254 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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E2F4Q16254 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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E2F4Q16254 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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E2F4Q16254 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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