Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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