Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SF1Q15637 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SF1Q15637 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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