Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SURF2Q15527 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms