Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms