Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHBQ15464 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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