Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEC23BQ15437 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms