Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RYR3Q15413 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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