Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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