Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms