Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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