Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms