Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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