Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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