Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1SQ13698 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms