Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CUL4AQ13619 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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