Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL3Q13618 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms