Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RIGQ13278 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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