Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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