Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PAPPAQ13219 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPPAQ13219 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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