Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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