Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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