Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXC1Q12948 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms